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与填料相比，使用磁珠具有很强的便捷性：
在使用磁珠纯化目标分子时，对样品的预处理要求低，如不需要澄清过滤等步骤，而使用填料纯化目标分子时，一般需要使用离心方式或者中空纤维素对样品进行处理，以防在层析过滤时造成层析柱的阻塞。
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